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医学大数据挖掘系列课程
多组转录组筛选癌症预后标志物 10 集 📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi 📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi 📄 课时07.数据和代码下载见pc端左下角参考资料.swf 📄 课时05.Part5&生存相关基因的识别和验证.avi 📄 课
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多组转录组筛选癌症预后标志物10 集
- 📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
- 📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
- 📄 课时07.数据和代码下载见pc端左下角参考资料.swf
- 📄 课时05.Part5&生存相关基因的识别和验证.avi
- 📄 课时03.Part3&批次效应校正及效果评估.avi
- 📄 课时04.Part4&差异表达分析.avi
- 📄 课时06.联合多组转录组数据筛选癌症预后标志物讲解.avi
- 📄 课时03.基因家族预后作用的识别.avi
- 📄 课时01.分析流程概述.avi
- 📄 课时02.在线工具简介.avi
- 📄 课时04.识别基因家族在癌症中的预后作用--资料.swf
- 📄 资料.zip
生信套路分析-识别癌症亚型间特异性基因表达和突变模式9 集
- 📄 课时09.识别癌症亚型间特异性基因表达和突变模式（程序补充）.avi
- 📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
- 📄 课时10.见本课程pc端左下角参考资料.swf
- 📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
- 📄 课时08.Part8&GEO数据集验证.avi
- 📄 课时06.Part6&亚型特异性体细胞突变.avi
- 📄 课时05.Part5&亚型的生物学过程.avi
- 📄 课时07.Part7&亚型的生物标志物.avi
- 📄 课时04.Part4&亚型特异性基因获取.avi
- 📄 课时03.Part3&识别分子亚型.avi
基于基因表达和甲基化分析识别肿瘤预后因子联合分析6 集
- 📄 课时03.Part3&差异表达差异甲基化基因的获取.avi
- 📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
- 📄 课时06.基于基因表达和甲基化分析识别肿瘤预后因子（代码补充）.avi
- 📄 课时05.Part5&DLL3基因表达水平验证.avi
- 📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
- 📄 课时07.代码和资料见pc端左下角参考资料.swf
- 📄 课时04.Part4&预后相关差异基因的识别.avi
最终程序3 条
- 📄 2ENSG.zip
- 📄 RMA.zip
- 📄 数据.zip
识别自噬相关的预后标志物10 集
- 📄 课时11.左下角-参考资料.swf
- 📄 课时04.Part4&自噬相关风险标记的识别.avi
- 📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
- 📄 课时05.Part5&自噬相关标记与临床信息的相关性.avi
- 📄 课时09.Part9&风险标记与基因突变的相关性.avi
- 📄 课时08.Part8&癌症预后风险预测.avi
- 📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
- 📄 课时10.识别自噬相关的预后标志物-程序讲解.avi
- 📄 课时07.Part7&独立预后标志物的验证.avi
- 📄 课时06.Part6&独立预后标志物的识别.avi
- 📄 课时03.Part3&自噬基因表达模式的识别.avi
DNA甲基化标志物-代码和资料6 集
- 📄 课时07.左下角-参考资料.swf
- 📄 课时05.生存相关基因和甲基化的识别.avi
- 📄 课时01.分析流程概述.avi
- 📄 课时06.识别DNA甲基化生物标志物（代码讲解）.avi
- 📄 课时02.数据获取及预处理.avi
- 📄 课时04.关键模块的识别.avi
- 📄 课时03.差异基因和甲基化的获取.avi
lncRNA6 集
- 📄 课时04.Part4&预后相关lncRNA的识别.avi
- 📄 课时03.Part3&差异表达lncRNA的获取.avi
- 📄 课时07.见本课程PC端左下角参考资料.swf
- 📄 课时06.基于lncRNA表达谱识别癌症潜在预后标志物(代码补充).avi
- 📄 课时01.Part1&分析流程概述.avi
- 📄 课时05.Part5&lncRNA验证及功能分析.avi
- 📄 课时02.Part2&数据获取及预处理.avi
资料11 条
- 📄 3.验证批次效应：主成分分析.R
- 📄 3.验证批次效应：线性回归.R
- 📄 2.探针匹配+基因组重注释.R
- 📄 4.差异表达.R
- 📄 5.利用正常样本对单cox进行验证.R
- 📄 5.利用TCGA数据对单cox结果验证.R
- 📄 5.单因素生存内部交叉验证.R
- 📄 1.数据预处理+去批次.R
- 📄 3.验证批次效应：热图.R
- 📄 6.多cox生存分析.R
- 📄 5.单因素生存分析.R
Result1 条
- 📄 TCGA_data.rar
程序1 条
- 📄 代码.R
tcga1 条
- 📄 cluster.exe.lnk
- 📄 TreeView-1.1.6r4-win.zip
- 📄 gsea-3.0.jar
Picture7 条
- 📄 2-DifferentAnalysis.r
- 📄 1-DataProcess.r
- 📄 3-WGCNA.r
- 📄 4-Survival.r
- 📄 3-关键基因验证.r
- 📄 1-数据预处理.r
- 📄 2-关键基因筛选.r
关键基因验证-DLL36 条
- 📄 3个独立集验证.R
- 📄 风险标记与基因突变.R
- 📄 诺模图and校正曲线.R
- 📄 高低风险组与临床信息.R
- 📄 数据预处理.R
- 📄 gsea-3.0.jar
- 📄 独立预后因素.R
- 📄 Cox.R
- 📄 EAC.output.txt
- 📄 result.txt
- 📄 mutation_type_dictionary_file.txt
- 📄 exome_full192.coverage.zip
- 📄 TCGA.ESCA.varscan.9dab6855-ba5e-4afb-b3a0-f034a6f82eb2.DR-10.0.somatic.maf
- 📄 gene.covariates.txt
- 📄 chr_files_hg19.rar
Result85 条
- 📄 rawdata.zip
- 📄 GSE13898_series_matrix.txt
- 📄 consensus002.png
- 📄 标准化-898.txt
- 📄 标准化-898_1.txt
- 📄 898_exp.gct
- 📄 标准化-898.atr
- 📄 express-898.txt
- 📄 标准化-898.cdt
- 📄 898-亚型.txt
- 📄 consensus014.png
- 📄 标准化-898.png
- 📄 898_sub.cls
- 📄 consensus011.png
- 📄 consensus001.png
- 📄 consensus003.png
- 📄 GPL4372.txt
- 📄 417_去掉样本.txt
- 📄 consensus015.png
- 📄 GPL6102-11574.txt
- 📄 consensus013.png
- 📄 consensus010.png
- 📄 consensus005.png
- 📄 consensus006.png
- 📄 consensus012.png
- 📄 consensus004.png
- 📄 consensus002.png
- 📄 标准化-417.txt
- 📄 consensus008.png
- 📄 consensus014.png
- 📄 consensus007.png
- 📄 express-417.txt
- 📄 标准化-417_1.txt
- 📄 consensus009.png
- 📄 GSE19417_series_matrix.txt
- 📄 consensus002.png
- 📄 consensus011.png
- 📄 diff_exp.txt
- 📄 consensus009.png
- 📄 HUPER_core_exp.atr
- 📄 HiSeqV2
- 📄 consensus005.png
- 📄 tcga_huatu_1.txt
- 📄 HUPER_core_exp.txt
- 📄 tcga-亚型.txt
- 📄 图片1.png
- 📄 tcga_huatu.txt
- 📄 consensus012.png
- 📄 ESCA_clinicalMatrix.txt
- 📄 eca-tcga.txt
- 📄 consensus004.png
- 📄 go_diff.txt
- 📄 WANG_core_exp.txt
- 📄 WANG_core.txt
- 📄 WANG_core_exp.cdt
- 📄 tcga-sub.txt
- 📄 diff.txt
- 📄 consensus010.png
- 📄 HUPER_core_exp.jtv
- 📄 HUPER_BREAST_BASAL_VS_LUMINAL_UP.gmt
- 📄 consensus003.png
- 📄 WANG_core_exp.atr
- 📄 consensus006.png
- 📄 consensus007.png
- 📄 HUPER_core_exp.png
- 📄 consensus013.png
- 📄 consensus008.png
- 📄 sample.cls
- 📄 HUPER_core_exp.cdt
- 📄 tcga_sub.cls
- 📄 gsea-tcga.gct
- 📄 consensus014.png
- 📄 consensus001.png
- 📄 consensus015.png
- 📄 WANG_core_exp.png
- 📄 WANG_BARRETTS_ESOPHAGUS_AND_ESOPHAGUS_CANCER_DN.gmt
- 📄 Rplot.png
- 📄 silhou.png
- 📄 tcga_exp.gct
- 📄 HUPER_core.txt
- 📄 WANG_core_exp.jtv
- 📄 标准化-tcga.txt
- 📄 kegg_diff.txt
- 📄 goujian.gmt
- 📄 methy450_module_site.txt
- 📄 Exp_module_gene.txt
- 📄 Methy450_module_num.txt
- 📄 Methy450_DEsite_gene.txt
- 📄 Methy450_limma_all.txt
- 📄 Methy450_module_trait_PandCor.txt
- 📄 methy450_module_gene.txt
- 📄 Methy450_survival_all.txt
- 📄 Venn_differentanalysis.csv
- 📄 Exp_survival_all.txt
- 📄 Exp_module_num.txt
- 📄 Methy450_module_site_PandCor.txt
- 📄 Venn_WGCNA.csv
- 📄 Exp_module_gene_PandCor.txt
- 📄 Exp_limma_all.txt
- 📄 Methy450_survival_select.txt
- 📄 EXP_DEmRNA.txt
- 📄 Exp_survival_select.txt
- 📄 Clinical_table.txt
- 📄 Methy450_DEsite.txt
- 📄 Exp_module_trait_PandCor.txt
- 📄 2-limma.R
- 📄 1-探针表达谱到lncRNA标准化表达谱.R
- 📄 5-生存分析.R
- 📄 4-LASSO-lncRNA对GSE打分.R
- 📄 3-LASSO.R
